基本药物制度（以下简称“制度”）是整个新医改关键性、基础性的一步，这一步走好了，医药行业许多剪不断、理还乱的纠缠将渐梳渐顺。基本药物制度是一个系统，包含：《国家基本药物采购配送的若干意见》、《医疗机构使用基本药物管理办法》、《国家基本药物质量监督管理办法》、《国家基本药物临床应用指南》、《国家基本药物处方集》、发改委的国家基本药物的零售指导价格、工信部的基本药物企业遴选标准等。基本药物制度将对医药产业链产生深远的影响，其关键点在哪里？如何理解？
建立基本药物制度的首要目的直指“看病贵”，“以药养医”政策下，公立医院和医生的趋利性使得贵药盛行，廉价药惹人嫌弃，因此制度强迫全部基层医疗机构、公立医院及药店全部或者部分配备，保证几乎都是廉价药的基本药物可以容易获得，然后强制使用，以此遏制“看病贵”问题。当然，仅靠基本药物并不能彻底解决看病贵，还有其他医改措施。
其他目的，如保证基本药物的可获性等，此处不再展开论述。