工业废水与生活污水的水质存在较大差异，且含有毒性，因此工业废水的处理方法也有别于生活污水。需要根据废水的种类、数量等分别以不同的方法处理工业废水。
通过分析各类工业废水排放占比及COD 排放占比，化工制造业和造纸业的工业废水排放占比较大，食品加工和造纸业的COD 排放较多。一般来说，处理工业废水要遵循以下七大基本原则：（一）工厂要尽量选用无毒工艺，从根本上降低有毒有害废水的排放（二）对于必须使用有毒原料的，严密把关，采用合理的流程和先进的设备，避免有毒物质泄露（三）为方便后期的处理和回收，有毒废水与无毒废水分流（四）能够循环使用的废水尽量循环利用，不要直接排入下水道，造成浪费和增加污水处理负担（五）食品加工废水、制糖废水和造纸废水等有机废水可以排入城市污水系统进行处理（六）像酚、氰废水等可以生物降解的有毒废水经过处理后，经相关部门批准后可以排入城市下水道做统一处理（七）对于那些难以降解的有毒废水要采取单独处理，不得排入城市下水道。