金融稽核的层次，从稽核的内容分，可分为安全性稽核、合理性稽核和最优管理稽核三个层次。

一、安全性稽核

安全性稽核，即稽核对银行经营安全构成威胁的因素是否存在，以及如何从监督的角度防范该类事件的发生。

安全性稽核，属于操作层面，侧重于金融业的安全性方面，是目前稽核工作中主要的形式，经过多年的发展，已形成了较为成熟的一套稽核办法。其重要的特点是从已办理的业务中去发现问题及可能产生问题的趋势，是一种事后的监督，往往在发现问题时已造成损失，或已成既成事实难以改变。因此，安全性稽核是稽核工作的第一个层面，是较粗浅的层面。

二、合理性稽核

合理性稽核，是稽核在没有违反金融规章制度的基础上，是否以最合理的方式开展业务，从而取得更高的经营效益。

合理性稽核，属于管理层面，侧重于金融业的效益性方面，在目前稽核工作中有所涉及，但涉及不深，还处于探索阶段，尚未形成完善的稽核办法。其重要特点是从目前正在实施的经营管理方案中，去发现与效益最大化要求不相符的环节，并提出建议，进行纠正。从其特点看，监控点有所提前，对被稽核对象要求也有较大提高。因此，合理性稽核是稽核工作的第二个层面，是发展了的层面。

三、最优管理稽核

最优管理稽核，是稽核经营管理层制订、实施、调整的企业经营发展战略在可以预测的所有情况下是否已达到最优的程度。

最优管理稽核，属于战略决策层面，侧重于金融业的战略规划方面，在目前稽核工作中几乎没有涉及，但它是今后稽核工作的一个重要组成部分。其重要特点是稽核目前尚未实施、或即将实施的总体经营战略是否符合国家宏观经营政策、企业当前及未来竞争形势、股东利益最大化等方面。从其特点看，监控点完全在事前，稽核的是企业生存与发展的根本问题。因此，最优管理稽核是稽核工作的最高层面。

稽核的三个层面是一种递进的关系，从操作层面到管理层面，再到战略决策层面，从低级递进到最高级，且后一级以前一级为基础。同时稽核的三个层面也是一种互补关系，分别侧重于不同层次，不同方面。三个层面稽核的实施，涵盖了金融业所有的业务范围和所有的管理层次，从而实现全面的稽核，全面的监控。