作为益生菌与中药共生共存,互相修饰而生成的“菌药养生功能食品”，典型特点就是生物转化。其优势包括以下五个方面。

一是保护中药活性成分免遭破坏。

菌药是在常温、常压等较为温和的条件下进行的生物转化，故能最大限度地保护中药中活性成分免遭破坏，特别是对热敏感的芳香类挥发油、维生素等活性成分更能有效地加以保护。专家认为，发酵中药在中药加工工艺上是一个创举，有望解决中药在煎、煮、熬、炼、蒸、浸等传统工艺中，活性成分难于最大限度提取的难题。

二是提高中药药效。

相对而言，菌药的分子量较小，因而具有在人体中吸收较快、较完全、治疗效果较好等特性。药物进人人体后不能直接被利用的有效活性组分，通过微生物将其降解成小分子活性物质而被直接利用，还能除去大分子杂质，大大提高中药的药效。小分子活性物质由于其更易于通过血脑屏障而与人体细胞蛋白结合，因而比大分子物质有更高的活性。例如，2g芥子发酵产物的药效等于未提取的芥子50g的药效，经国家卫生部药物检验所试验证实，菌药的药效是普通水提法的4——28倍，大幅度地改变了中药的药性，满足了现代人又要治病快，又没副作用的需求。

三是提高中药利用率。

菌药通过多次发酵，大部分营养物质都能充分有效地被吸收利用。这样即可节省药源和提高企业的经济效益，又有利于资源保护与持续利用。

四是产生新药效。

菌药选用的人体有益菌种本身具有补充或增强原有药物的功能，另外，中药经多菌种的混合发酵后与原有药物相比产生了新的活性物质，如，产生了多种人体代谢所需的酵素，从而具有新的保健、预防和治疗功能。

五是为中药活性成分结构修饰提供新途径。

中药活性成分一般结构复杂，常有多个不对称碳原子，利用化学合成来进行结构修饰存在着得出率低、反应专一性差、副产物多等缺点，既费事费力效果又不佳。近年来，以微生物为反应器进行中药活性成分的生物转化和生物合成，有望为这类中药活性成分的获得提供新的途径。六是有利于提高中药现代化的水平。

利用微生物发酵来生产发酵中药具有较高的技术水平，该新技术可实现生产工艺可控，能确保所得产物的产品质量，且制剂方便，便于与国际标准接轨，有利于提高我国中药现代化的水平。