物化法主要根据制药废水的水质特点采用物化处理作为生化处理的预处理或后处理工序． 目前主要包括混凝、气浮、吸附、氨吹脱、电解、离子交换和膜分离法等． 其中混凝处理方法比较成熟，但容易产生二次污染，因此多作为预处理工艺． 膜分离技术能够处理浓度高、生化性差的制药废水，但是存在膜组件价格昂贵、难清洗及膜污染等问题． 吸附法中，虽然吸附剂对水中的BOD5、色度、CODcr 和绝大多数有机物有优异的去除能力，但是吸附剂再生能耗大，并且再生后的吸附能力有不同程度的下降，这给吸附法的使用带来了不可忽略的问题．

组合工艺技术：由于单一的工艺在处理效果和处理费用方面已经很难达到预期目标，因此各种工艺技术的有效结合成为主要的废水处理方法． 周俊采用催化氧化预处理+水解酸化+接触氧化组合工艺处理合成类制药废水，进水COD 为25 g /L 预处理后COD 去除率为80%，处理后出水COD 小于0. 5 g /L，pH 为6 ～ 9，该系统合理的流程组合充分体现工艺设计的合理性和先进性，并能有效地达到处理制药废水的目的． 宋吉娜等采用Fenton 氧化+混凝沉淀+水解酸化+好氧工艺处理COD 高达16 ～ 20 g /L 的制药废水，好氧工艺之前去除了部分COD 并提高了可生化性，再与低COD 为1. 8 ～ 2. 2 g /L 的设备清洗排水和生活污水混合，最后经过好氧工艺处理，出水COD 达标．