在项目型组织结构里，每一个工作部门只有唯一的一个上级领导或上级部门，即上下级成直线型的领导与被领导的权责关系，一级服从一级，上级工作部门在所管辖的范围内对直接下级具有直接的指挥权，下级部门必须绝对服从。项目型组织结构中的工作部门一般是综合设置的，部门主管人员要监管各种管理业务，一切由个人决定。项目型组织结构中的每一个工作部门，只有唯一的上级领导部门，它的最大优点是可以防止产生多源指令、政出多门。对一个工作部门来说，可以避免接受多个相互矛盾指令的情况。所以，在有些按线性组织结构建立系统的组织中，每一工作部门内的负责人只设正职，而不设副职，以保证权力的唯一性。其缺点是工作部门的负责人责任重大，往往要求其是全能式的人物，组织内横向联系及相互协作少，缺乏合理分工，专业化程度低。