平衡矩阵项目组织结构是对弱矩阵组织结构的改进，为强化对项目的管理，在项目团队中，从职能部门参与本项目的成员中任命一名项目经理，赋予一定的权力，对项目总体与项目目标负责。平衡矩阵结构较弱矩阵结构对项目管理有利，项目经理可以调动和指挥相关职能部门的资源来实现项目，在项目上有相应的权力。
强矩阵组织结构具有项目的线性结构的主要特征。它是在原有的职能组织结构的基础上，由系统的最高领导任命的对项目全权负责的项目经理，项目经理直接向最高领导负责。或者，在系统中增设与职能部门同一层次的项目管理部门，直接接受系统最高领导的指令。项目管理部门再按不同的项目，委任相应的项目经理。项目管理部门的负责人也是项目经理的经理。强矩阵组织结构对实施大型、复杂性项目比较有利。