人类的信仰、经验、立场和判断，大多自觉或不自觉地基于自己头脑中存储的知识或信息。是的，人类最信任的实际上只有自己，相信自己的头脑、相信自己的眼睛耳朵、相信自己的阅历与感悟，但这恰恰是世间许多悲剧得以不断出现并重复的根源。

人类对“知识”的获取是被动的，完全来自于自身以外的传承和教化，所有人的基因深处都没有携带这个世界的任何记忆，我们所谓的本能、直觉、情感都不是“先天”的产物。孪生人群和克隆技术证明了这一点：不管外在性状如何相似的个体，抑或基因构成完全相同的个体，在后天行为上也不会完全相同。那么，人类自身意识的形成过程，就是一个大脑接受并存储历史知识、现实信息及假说的反馈系统。“垃圾输入一垃圾输出”(Garbage in-Garbage out)本是计算机模拟研究中一条著名原理，人类的知识获取与意识形成是否遵循着与之相仿的规律呢？

有人说：“达尔文的进化论是当代思想中最大而无用的东西。它很大，但几乎没什么用，是人们迷信般敬畏的目标。”

人类的起源，不仅是人类探索自身在宇宙中存在意义的持续动力，而且是人类构建认知基础数据库的重要支撑和行为指南。

达尔文的“物种进化论”尝试着去解释人类的起源，打破了十几个世纪以来桎梏世人思想的“上帝创造人类”的结论，从根基上动摇了中世纪的宗教“神学”，取而代之地成为“科学”殿堂的奠基石和顶梁柱。由于当时缺乏考古学、古生物学以及基因学方面研究的证伪，达尔文的“物种进化论”尽管存在诸多无法自圆其说的“硬伤”，但是借助资产阶级革命的历史契机却最终高举“科学”大旗傲然胜出，上帝造人的“神学”倒下了，物种进化的“科学”站起来了，但一切以“真理”之名掩盖了“假说”之实的行径可以蒙蔽一时却难以蒙蔽一世。

今天，随着人类起源研究的不断推进，达尔文进化论面临着三大理论难题。第一：大约5亿到6亿年前的寒武纪的开始之时，绝大多数无脊椎动物和脊索动物在几百万年的很短时间内出现了。但是用达尔文进化论的从“量”到“质”的渐进发展观点却不足以解释为什么会在短短的几百万年时间里会出现如此多的新动物；第二：达尔文从“适者生存”的角度，勾勒了生物进化的树状演化图景。但是，在分子水平上，许多变异(突变)并不显著地影响生物的生存能力，因此不会由自然选择的力量为主导决定其在进化历史中的去留，这些变异导致的微小的进化不是经典的“达尔文学说”能合理解释的；第三：某些遗传结构本身具有适应意义和进化意义，能够在自然选择的力量所不及的情况下，“驱动”生物进化,但是达尔文进化论并不涉及遗传因素。

三大理论难题曾经是达尔文的“物种进化论”战胜“上帝造人论”的三把“长矛”，现在却因无法自圆其说而戳破了自己“真理外衣”。还原达尔文的“物种进化论”的假说地位，并不是耻辱，以假说之实却冠以真理之名，却是学术假货的可耻行径，更使原本看似崇高神圣的“科学”蒙羞，否则达尔文的“物种进化论”很可能会成为“科学”殿堂坍塌的第一根柱子……