长期以来，制药废水中所含的难降解有机物是处理的难点。研究人员一直在探索既经济又有效的技术来攻克这一难关，经过不断的研究，出现了一些新兴的处理技术。高级氧化是其中的一类处理方法，是利用氧化剂、光照、催化剂等的作用形成具有活性极强的自由基来降解有机污染物。
芬顿试剂法是利用Fe3+ 或Fe2+ 作为催化剂，然后与H2O2反应形成具有极强氧化性的羟基自由基。该物质能够氧化很多有机物质，而且在反应过程中无需高温高压，在常温下即可实现。此外，反应的设备也较为简单。但其存在一个缺点是氧化能力相对较弱，而且在反应结束后出水中会含有大量的铁离子。有研究者利用芬顿试剂法处理COD 浓度为36200 mg/L 的制药废水，实验结果表明，在H2O2和Fe2+ 的使用量分别为3 mg /L 和0.3 mg /L 的条件下，COD 的去除率达到最大且为56.4%，而且降解的有机物时间很快。还有研究着利用芬顿试剂法处理COD 浓度为3000mg/L 的青霉素废水，在H2O2 和FeSO4·7H2O 的使用量分别为0.6%和0.2%的情况下，反应1h 的时间，出水中COD 的浓度约为900 mg/L，说明芬顿试剂法对制药废水有着很好的处理效果。