五、联盟存在的问题
战略联盟与任何的企业战略一样，也有其不可避免的局限性。
（一）不可避免的竞争
联盟协议是战略联盟中最重要的法律文件，大部分的联盟协议规定，联盟企业不能与联盟所涉及的领域发生竞争，但是企业在签署该协议时务必谨慎，因为联盟双方的战略地位在将来有可能发生变化，与联盟发生冲突是彼此所不愿看见的。联盟双方应对所拥有的技术应当进行适当保护，否则，其中一方有可能将对方技术用于私自目的，甚至与主要竞争对手成立另一个联盟，对另一方构成威胁。
（二）难以规避的风险
组建战略联盟可以分担风险但无法避免风险。不管协议制订的过程是多么小心谨慎，技术上的失败仍然是技术联盟失败的主要原因之一。在大多数技术开发联盟中联盟本身并没有失败，而是技术开发遇到了攻关难题，导致联盟不能充分发挥其作用。
（三）无法有效地经营运作
联盟一旦制定好正确的战略，成功与否将取决于经理们的经营运作，如果选择了不善经营的经理，那将很可能导致联盟的失败。另外，在联盟中，若过分相信联盟伙伴处理问题的能力，其结果常常是不如人意的。正因为有的经理对联盟没有给予足够的重视和支持，联盟往往因缺乏有力的支持而没能发挥应有的作用。
（四）企业战略转换
有些联盟的建立是为了克服彼此的弱点、取长补短。但是随着时间的推移和企业战略环境的变化，当其中一家企业的弱点不复存在时，它的战略也就随之发生变化，这样联盟就失去了存在的基础，而另一家企业将被迫改变它的合作战略和企业战略。
上世纪90年代，“活力28”与德国帮特色公司结成联盟，但是这场联盟并没有使“活力28”达到提高自身竞争力的目的，反而使它陷入了困境。当时，“活力28”想通过战略联盟借助对方技术、资金、人才、营销经验等，来增强自己品牌的实力，达到维持生存或扩张市场的目的，但没想到对方却更高一筹，其联盟不是要继续打造中国的品牌，共享中国品牌成功后的利润，而看中的是中国品牌手中的生产线、劳动力，以及大片忠实的消费者群体甚至是销售网络，最终来冷冻中国的合资品牌，以达到扩大外资自有品牌市场、赚取更高利润的目的。所以，这场联盟从一开始就南辕北辙，其结果注定要分道扬镳。