新修订的《中华人民共和国耕地占用税暂行条例》（以下简称新条例）将于2008年1月1日正式施行。新条例虽然提高了税额标准、将外资企业纳入征收范围、从严规定了减免税项目、明确了征收管理适用的税法，使之更趋合理，但笔者以为，在税额的设计、对未获准占用耕地的税款如何征收、实际占用耕地面积的核准、临时占用耕地的退税等诸多方面，依然存在一些纰漏。

　　我们知道，合理的耕地占用税税额，应该起到抑制占用耕地的作用，使耕地占用税负担成为占有者确定占地时主要考虑的因素。这不仅适用于人多地少的地区，而且同样适用于人少地多的地区。更何况，执行《中华人民共和国土地管理法》不区分人地占比，全国所有的耕地都一样得到保护。而新条例却依旧按人均占有耕地来确定税额，人少地多的地区税额低，人多地少的地区税额高，高低相差一半。这在一定程度上是否纵容了人少地多的地区乱占乱用耕地的行为？

　　新条例第四条规定，“耕地占用税以纳税人实际占用的耕地面积为计税依据”。可以理解为只要占用了耕地，不论合法与否，都应缴纳耕地占用税。但新条例只提到“获准占用耕地的单位或者个人”，没有提到未获准占用耕地的税收问题。时下，非法占用耕地现象在一些地方依然存在。就连《中华人民共和国土地管理法》对非法占用耕地也作了罚款等规定，只是没有征税、补税的规定。难道非法占用耕地不用缴税？显然不可能！笔者以为，对非法占用耕地的行为，不仅要征税、补税，而且还要区分情况，加成或加倍征收。

　　同时，“耕地占用税以纳税人实际占用的耕地面积为计税依据”，这里的“实际占用的耕地面积”还有待具体明确。我们知道，耕地上的建筑物，除了基底占用了耕地，周边的空地面积也无法耕种（一般要占到基底面积的20%至30%）。这部分空地未经土地管理部门批准（事实上已占用），在执行新条例时，使征收部门很难操作，到底是征还是不征？如果强行征收，显然有合理不合法之嫌；如果不收，又白白地损失了国家的土地和农民应获得的补偿。

　　新条例第十三条规定：“纳税人临时占用耕地，应当依照本条例的规定缴纳耕地占用税。纳税人在批准临时占用耕地的期限内恢复所占用耕地原状的，全额退还已经缴纳的耕地占用税。”笔者对此也有不同的看法。《中华人民共和国土地管理法》明确规定：经批准的临时用地，土地使用者除了签订临时使用土地合同，还应按照合同的约定支付临时使用土地补偿费。但并没有规定日后还要退还土地补偿费。在同一块土地上收取的税和费，且都用于了“三农”，为何偏偏要把其中的“税”退给土地使用者呢？