由于普通的无机混凝剂在废水处理中药剂投加量大，处理费用高，且随水质的变化需改变加药条件，因此运行管理比较复杂。最近几年的研究结果表明，有机絮凝剂特别是人工合成的高分子絮凝剂对印染废水显示出更好的脱色效果。目前用于印染废水中的有机絮凝剂主要分为表面活性剂、天然高分子及其改性剂、人工合成的有机高分子絮凝剂三大类。

1 表面活性剂：有研究者用十二酰胺基乙基吡啶氯化物或十六烷基溴化吡啶盐处理水溶性阴离子染料废水，如澄碱H2R、Ostazin 棕H4GR、Ostazin 亮橙H2R 等，其处理效果都很理想。表面活性剂在印染废水处理中还可用做助凝剂。陈润铭[16]在处理含碱性品红等阳离子印染废水时，利用十二烷基苯磺酸钠与阳离子染料发生化学作用，靠氢键及静电结合，使原来带正电荷的阳离子染料粒子转变为带负电荷的粒子，再与PFAS 絮凝剂产生絮凝沉淀，色度去除率可达99%。阳离子表面活性剂与印染废水中染料分子的络合反应具有较强的选择性。通常情况下，单独使用难以达到很好的效果，往往在使用时和铝盐复配。

2 天然高分子及其改性剂：天然高分子絮凝剂的主要品种有淀粉及其淀粉衍生物、木质素衍生物和甲壳质衍生物三大类。利用海虾、蟹壳为原料，制得的壳聚糖为阴离子型天然有机高分子絮凝剂，用来处理印染废水，COD 去除率可达85%以上，形成的矾花颗粒大，沉降快。天然高分子絮凝剂通常使用农副产品中的有机高分子物质提取制得，价廉，易降解，但电荷密度较小，分子量较低，且易发生生物降解而失去絮凝活性，故使用范围不广。