1 生物处理：生物处理是利用微生物处理可生物降解的可溶的有机污染物或是将许多不溶的污染物转化为絮状物。污染物的去除可通过有氧、无氧或缺氧段三种方式去除。一般电厂利用有氧方式去除BOD5，通过厌氧或缺氧的方式去除金属或是营养盐，微生物可以通过呼吸作用将硒酸盐或亚硒酸盐还原为元素态的硒，吸附在微生物细胞表面。

生物处理可以有效地去除脱硫废水中的硒（降至μg/L 级）、汞（降至ng/L 级）等重金属元素，但是其系统复杂，造价高且容易形成有毒的有机硒和有机汞，造成二次污染。

2 混合零价铁技术（HZVI）：研究发现，利用零价铁可以有效的减少废水中的硒酸盐或是亚硒酸盐的含量，但是随着反应的进行，铁表面容易钝化，影响零价铁的反应活性。后有学者将Fe2+引入零价铁处理系统，发现零价铁的反应活性有了明显提高。实验研究表明，混合零价铁技术对汞的去除效率达到99.99%（出水浓度<0.005μg/L），硒的去除效率达99.8%（出水浓度<7μg/L）。此外，与生物处理等技术相比，其运行费用较低。目前，此技术还在工业化试验阶段，并未投入使用。