自从施行阳光私募以来，私募基金的运作模式逐步为世人掌握。从私募基金的运作来看，信托公司是至关重要的一个环节，但也存在许多不规范的地方，这从许多信托公司发布的信托产品中就能发现端倪。
首先，许多信托公司是私募基金的资金支持者。从一个简单的模式就看出：私募基金将持有的股票质押给信托公司，信托公司以此为标的设立集合信托产品，私募出资认购部分，大部分面向社会特定公众销售，资金由私募基金使用。有的私募基金甚至用融来的资金继续购买同一股票，如此反复，将股票推高。这类产品一般都使用优先/次级结构。
这种模式私募资金承担很高的风险和成本。
一是高杠杆作用，私募只需投入少量资金就可以吸收大量社会资金，有的杠杆比例甚至达到1：10以上，一旦市场出现下跌，这种高杠杆将带来巨大的风险。
二是这种模式约定当质押股票下跌到一定的警戒线时，私募要补足资金，使质押股票价值保持在警戒线之上，需要私募资金有雄厚的资金支持和社会责任心。一旦操盘者认为自救无望，拒绝追加资金，将会导致信托计划的清盘，导致投资者重大损失。
三是融资成本较高。从目前的产品设计看，普遍都在8%以上。高成本的制约，必将促使私募资金寻求高风险高收益的投资。
四是押品估值风险。私募资金质押的股票，一般都是增发或其他途径获得。这类股票成本低于股票市价，而信托公司一般会参照市价进行估值，这将给信托公司带来错觉，有时估值高于私募资金的持有成本，使得私募资金觉得以此融资更划算，能获得更高的额度。会一而再、再而三的进行融资，额度随着押品市价的上升而扩大，对私募资金更加有利。而风险也会因此逐步累积，这需要信托公司自身承担。
其次，有的信托公司参与到私募资金的不规范运作当中。比如，有的私募资金坐庄某股票，但为防止大小非减持等因素影响，会影响上市公司和信托机构，使上市公司股东持有大小非为标的进行融资。这样可以帮助私募资金锁定筹码，减少操作的不确定因素。有的甚至赋予大小非股东某些选择权，使得市场操作的公开、公正、透明性遭到巨大挑战。这种模式一般比较隐蔽，有时通过好几家关联公司进行，很有迷惑性。
这些都可以从信托公司的集合信托产品发行的公开信息中得到，有心人可以进一步挖掘，促进金融证券市场的健康发展。