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科技型中小企业技术创新基金（以下简称创新基金）是1999年经国务院批准，科技部、财政部共同管理的一项专门用于扶持和引导科技型中小企业技术创新活动的政府专项资金。创新基金在促进中小企业技术创新，优化科技型中小企业创新创业环境，引导地方与社会资金等方面取得了显著的成绩。
根据国务院办公厅转发的《科技部、财政部关于科技型中小企业技术创新基金的暂行规定》，为了充分体现政府资金的宏观政策导向，明确创新基金年度支持重点和技术领域发展方向，科技部组织专家结合国家经济社会发展需求、科技发展趋势和我国科技型中小企业的特点，修订编制了《2009年度科技型中小企业技术创新基金若干重点项目指南》（以下简称《指南》）。
2009年《指南》根据党中央、国务院对发挥科技创新的支撑作用，促进经济平稳较快发展提出的新的要求，以科学发展观为指导，以增强自主创新能力为核心，积极应对国际金融危机，充分体现科技部为扩内需、保增长、调结构、上水平提供科技支撑的工作目标，发挥创新基金的引导作用，注重解决当前市场急需和产业升级的关键技术问题，加大对国家十大重点振兴产业尤其是纺织轻工等行业具有带动作用的关键技术、关键创新产品的支持；加强对能源、资源、环境、卫生健康、公共安全等领域关键技术创新的支持；紧密围绕科技部重大专项的实施，加快推进科技创新成果的市场转化，尤其是前瞻性、战略性产业项目的培育；加大对以创业促就业的初创期小企业创新项目，尤其是毕业大学生、研究生（包括海外留学生）在大学科技园、创业中心等创业服务机构内创新项目的支持；建议和完善为科技型中小企业创新活动服务的公共技术服务平台建设，引导中小企业向专、新、特、精方向发展；积极推进和完善引导和促进创业投资发展的风险补助、投资保障项目，扶持和壮大一批具有创新能力和自主知识产权的科技型中小企业，帮助科技型中小企业渡过困难期。
2009年《指南》进一步细化了对不同阶段申报项目的成熟程度和相关特殊申报要求的说明，重点围绕促进我国经济平稳较快发展，增加了若干重点支持领域和重点项目优先支持内容，进一步明确了不支持的范围。
目 录
9. 干细胞技术、RNAi技术、纳米技术、模拟多肽、多肽修饰技术及其产品
2. 采用数字化、信息化技术，提高设备性能及自动化水平的产品
第一部分 使用说明
创新基金主要通过无偿资助、贷款贴息和资本金注入等方式，对创业初期、商业性资金进入尚不具备条件、最需要由政府支持的各种所有制类型的科技型中小企业的技术创新项目或为中小企业技术创新活动服务的公共服务平台给予资金支持，促进高新技术成果转化，加快高新技术产业化进程，培育具有成长性好、创新能力强、管理规范、能参与国际竞争的科技型中小企业群体，引导地方政府、企业、风险投资机构和金融机构对科技型中小企业的投入，为中小企业走技术创业之路，顺利进入成长期起到铺垫作用。
《指南》的编制充分体现政府资金的宏观政策导向，结合国家经济社会发展需求、科技发展趋势和我国科技型中小企业的特点，明确创新基金年度支持重点和技术领域发展方向，引导科技型中小企业和公共服务平台申请创新基金的支持。
《指南》作为创新基金申报和立项审查环节中的一个重要文件，进一步明确了创新基金支持的范围和主要着力点，是企业准备申报材料的重要依据，是地方组织项目申报并进行初选的重要依据，是创新基金项目专家评审的重要依据。
《指南》共分为四部分，即：使用说明、政策与目标、重点项目优先支持技术领域、一般项目优先支持技术领域。在政策与目标部分，介绍了创新基金宗旨、创新基金运行机制、创新基金立项审查机制、本年度创新基金支持的重点和各类项目立项审查重点。
《指南》中重点项目优先支持技术领域部分，详细描述了重点项目支持的内容。为适应科学发展观的要求，促进国民经济实现又好又快的发展，2009年度创新基金继续设立并适当扩大重点项目。重点项目将围绕新能源开发、节能降耗、减少环境污染以及卫生健康等主题，依据国家和地方经济发展的重点需求，选择对产业和行业有影响、带动作用的关键技术、关键创新产品作为突破口，重点支持一批具有高成长性企业的快速发展。
《指南》中一般项目优先支持技术领域部分，根据高新技术产业相关的主要领域，按照技术领域、子领域、方向三级分类编排，介绍了2009年度创新基金支持的范围。在技术领域和子领域中，分别介绍了本技术领域（子领域）目前发展现状及趋势、企业申请时的注意事项等。在方向层面上，具体描述了各方向所支持的项目内容，以及申报材料的特殊要求等。
申请创新基金的企业在使用《指南》时必须注意：
1. 必须按照企业所掌握的自主核心技术和产品应用范围，在《指南》中选择一个方向申请创新基金，并按照相应的申报要求准备材料。没有明确列入《指南》的项目，如果申报项目技术含量高、创新性强、产品市场前景好，而且申报企业具备较强的开发能力，也可以提出申请，并按最相近的技术方向准备申报材料。
2. 《指南》中，在不同技术领域的方向上有些行业或产业有交叉，企业应按照拟申请项目的技术创新重点，参照《指南》说明，选择相应技术领域或子领域。
3. 申请企业准备申请材料时，需特别注意在技术领域、子领域、方向三个层面上对企业能力、项目所处阶段、项目所应具备的条件、申请资助的方式、以及应提供的相关附件材料（如：专利证书、许可证、批文、查新报告、检测报告、用户报告等）等有关方面的要求。请申请企业按照有关要求进行准备，并提供相应的附件材料。凡不能满足要求的企业，请不要申请。
4. 凡属于在《指南》的技术领域、或子领域、或方向中明确指出不支持的项目，或其它不符合产业政策、技术已经比较成熟以及市场竞争激烈而又没有明显竞争优势的项目，请企业不要申请。