香港《大公报》爆说，邱晓华的私生活有问题；他在上海有一情妇，两人还有一女。虽然陈良宇案发引起政坛大地震，但思女心切的邱晓华还是在今年中国国庆长假期间，专程从北京飞往上海，看望情妇和女儿。

《大公报》报道称，知情人士透露，中纪委调查组是从另一名社保案涉案者、上海福禧投资董事长张荣坤身上找到突破口，从而牵出邱晓华的问题。邱晓华和张荣坤同是全国政协委员，两人都在经济组，互有交往。据报道，今年两会上，有记者注意到两人谈笑甚欢。

有观察人士分析指出，从张荣坤对邱晓华进行公关来看，可见其手腕和思路与众不同。首先，邱晓华所处的国家统计局属于“清水衙门”，比较容易接近；其次，邱少年得志，48岁即官拜正部级，属于未来的政坛明星；再次，邱晓华虽然手中权力不大，但凭其地位和潜力，穿针引线绝对没有问题。

报道说，据深谙中国政情的人士分析，如果高级官员因为严重违纪而被中纪委调查的话，那么这位官员极有可能已经被“双规”。涉案人员假若触及有关法律，那么当事人最终将进入法律程序直至被审判。

2006年10月12日，是一个平常的星期四。国家统计局局长邱晓华照例开始了一天紧张的工作。工作重点之一，是向同事们传达六中全会精神(邱列席了十六届六中全会)。

然而到了下午，邱晓华身影即消失，中组部有关负责人在局内召开会议，宣布邱晓华被免职，国务院发展研究中心原副主任谢伏瞻继任。三个小时后，新华社公布了任免消息。