农业补贴制度的形成过程经历三个关键年份。2002年在东北实行了粮种补贴，2004年开始实施粮食直接补贴，2006年在实施农资补贴和农机补贴之后，农业补贴政策的框架体系基本形成。

　　农业补贴制度的主要内容是：生产直接补贴，技术服务补贴，关键技术补贴，动植物疾病补助，生态资源环境奖励补助，风险防范补助等。自2002年以来，我国农业补贴品种增加、范围扩大、标准提高，补贴政策体系基本形成。2012年中央财政安排的补贴资金达2503亿元。2011年的农民收入中，补贴收入占到8%。补贴的功能和作用有两个，分别是支持生产和支持收入。生产者的收入增加能够调动农民的生产积极性，反过来也能间接起到支持生产力作用。

　　主要的农业补贴有以下四大类：（1）对粮食主产区的种粮补贴，我们实行粮食直接补贴，简称粮食补贴。（2）对一些农民使用优良品种进行补贴，简称良种补贴。现在良种补贴主要有11种产品，粮食里的小麦、玉米、大豆、稻谷；油料里面有油菜、花生；棉花；马铃薯和青稞；再加上能繁育母猪补贴和奶牛良种繁育补贴。（3）农机补贴分两种，一种是农机购置补贴，另一种是重点作业补贴。现在农机购置补贴的种类，已经由之前的农作物种植业机械，扩大到林业机械、牧业机械、抗旱机械和排灌机械，几乎覆盖了所有的农机具。同时我们为了鼓励农民既购买农业机械，还要更好地使用农业机械，我们还给农机重点作业环节补贴，比方说跨区收割的燃油费补贴，免收过路过桥费等。（4）农业生产资料综合直接补贴。我们的办法是，将农民种的一亩地，需要使用的农业生产资料、各种产品统算下来给予补贴，所以我们叫综合补贴。

　　农业补贴政策有贡献，但也有缺陷。我国农业补贴政策存在以下三方面问题：补贴总量不足，标准相对偏低；整体规划缺乏，结构不尽合理；管理机制不完善，效应发挥不充分。

　　2012年12月召开的中央农村工作会议提出，我国农业生产进入了高成本、高风险、资源环境约束趋紧、青壮年劳动力紧缺的新阶段，农业补贴政策须进一步完善。目前，我国大部分地区依然是小规模农业，需要国家的政策补贴；我国的补贴与发达国家相比还有很大的差距。此外，离世贸组织规定允许的补贴空间还有距离，国家财力增长等因素也决定了要不断增加农业补贴。

　　对农业的支持保护是加快发展现代农业，推进农业现代化的重要制度安排。进一步完善农业补贴政策的总体思路是：按照“四化同步”的要求，以加快现代农业建设为努力方向，坚持以保障国家粮食安全和重要农产品有效供给为中心目标，以促进农业生产方式转变和农民持续增收为两大重点任务，加强政策顶层设计、稳步增加总量、优化品种结构、强化绩效管理，以高补贴应对高成本、化解高风险、突破瓶颈制约，为农业农村经济健康快速发展，全面建成小康社会提供保障。

　　在具体的政策操作层面，应稳步增加总量，确保每年补贴增幅不低于财政收入增幅，力争农业补贴占农业增加值的比重从目前的5%逐步提高到8%；优化补贴结构，从补贴品种、补贴标准、补贴环节、补贴对象等方面完善政策；强化绩效管理，建立农业补贴的绩效评估和定期评价制度等。