钱学森从系统科学思想出发提出了现代科学技术的体系结构。钱老认为现代科学技术体系从横向上看有11大科学技术部门。即：自然科学、社会科学、数学科学、系统科学、思维科学、行为科学、人体科学、军事科学、地理科学、建筑科学、文艺理论；这是根据现代科学技术发展到目前水平所作的划分，今后随着科学技术的进一步发展，还会产生出新的科学技术部门。所以，这个体系是动态发展的系统。从纵向上看，每一个科学技术部门里都包含着三个层次的知识：直接用来改造客观世界的应用技术(或工程技术)；为应用技术直接提供理论基础和方法的技术科学；以及再往上一个层次，揭示客观世界规律的基础理论，也就是基础科学。技术科学实际上是从基础理论到应用技术的过渡桥梁。钱学森指出，这三个层次的知识结构，对其他科学技术部门同样是适用的。这是很重要的科学划分，很有启发性。唯一例外是文艺，文艺只有理论层次，实践层次上的文艺创作，就不是科学问题，而是属于艺术范畴了。科学知识的特点是，不仅能回答是什么，还能回答为什么。但人类从实践中还获得了大量的感性知识和经验知识，这部分知识的特点是只知道是什么，还不能回答为什么，所以进入不了现代科学技术体系之中。我们把这部分知识称作前科学。前科学处于该体系结构的底层。从前科学到科学再到哲学这样三个层次的知识，就构成了人类的整个知识体系。钱学森认为，马克思主义哲学是人类对客观世界认识的最高概括，也是科学技术的最高概括，处于11类技术科学的顶部。辩证唯物主义反映了自然界、人类社会和人的思维发展的普遍规律。因此，现代科学技术的发展，应该坚持马克思主义哲学的指导作用。另一方面，现代科学技术的发展，也为马克思主义哲学进一步概括和发展提供了丰富的材料，这又推动着马克思主义哲学的发展。