卫气的生理功能有三个方面，一是护卫肌表，是我们的防护衣，防御外邪入侵。二是温养脏腑、肌肉、皮毛等。三是调控腠理的开合及汗液的排泄，以维持体温的相对恒定。此外，卫气循行与人的睡眠有密切关系。当卫气行于体内时，人就入睡；当卫气出于体表时，人就醒来。

营气和卫气，都生于中焦，都以水谷精气为其主要生成来源，但是，营气在脉中，主内守而属于阴；卫气在脉外，主外卫而属于阳，二者之间运行必须协调，才能发挥其正常的生理作用。营卫二者协调时，人体才能有正常的腠理开合、正常的体温、正常的防御能力，才能白天精力充沛，晚上睡觉好；如果营卫不和谐，就会出现怕冷发热、无汗或多汗，抗御外邪能力低下，白天没精神，晚上睡不好觉等症状。