B2B电子商务其交易是发生在企业之间，通常每笔交易额巨大，在物流配送上，较易实现规模经济，因此物流问题不象B2C那么突出。也就是说B2B的物流问题，可以象传统商务的做法，委托“第三方物流企业”进行。目前我国电子商务B2B网站在发展中还存在以下问题 ：

(1) 重交易，轻信息。导致的是大量的B2B网站信息匮乏，难以聚拢人气，陷入了交易困难的恶性循环。
(2) 重信息收集，轻信息分析。这种状况难以为会员客户提供全面、深入的信息服务。
(3) 信息发布不规范，致使交易风险大。如商品价格报价有出入。
(4) 过度看重网上结算和物流配送，追求“全能”。
(5) 重技术，轻经营，重名利，轻时效.

      其中，信息的的收集整理、分析发布是一个重点，电子商务网站的运营包括信息内容的渠道来源，客户的吸引和后期管理、最终的收费形式等。B2B的也是一个生产销售型企业，生产是指市场行情报价、市场综合评价等具有指导意义的信息内容产品，销售是指信息到达客户眼前，并且让客户用眼球和时间买单，以及最终以广告、会员费等形式付费等。

      目前B2B生产企业的信息生产颇成问题，因为了解真实、准确、及时的市场信息，那需要相当的资金成本，而关于市场的综合评价等客观的信息，又缺乏权威的专业研究人士，所以可以说目前国内的B2B企业是在内容建设一塌糊涂的情况下进入战国时代的。